PeakMaster - Otimização de separações em Eletroforese Capilar

Quem trabalha com separações química, mais especificamente Eletroforese Capilar, as vezes precisa ter uma previsão de como uma certa separação se daria. Isso envolve a combinação de eletrólito de corrida (Background Electrolyte ou BGE), analito, dimensões do capilar e potencial de corrida.

Um dos programa para esse fim e bem conhecido no meio é o PeakMaster, desenvolvido pelo Group of electromigration separation processes do prof. Bohuslav Gaš.

O programa apresenta uma interface intuitiva e de simples operação. Seu banco de dados de BGE e analitos é bem extenso, sendo possível a inclusão de novas espécies.

É possível ter três tipos de resposta de detector: condutividade, detecção direta e UV-vis indireta.

O programa também permite exportar o eletroferograma para um arquivo ASCII do tipo CSV.

Ele não permite entrar com números fracionado no comprimento do capilar e na distância do ponto de injeção até o detector, apenas inteiros. Então, não é muito adequado para aqueles que trabalha com microchips de separação eletroforética (Lab-on-a-Chip ou Microfluidics). Lembrando que o programa considera um capilar cilíndrico, diferente dos canais de perfil retangular desses microchips.

O programa é para M$-Windows, mas funciona muito bem em uma máquina Ubuntu 8.04 sobre o Wine. Apenas fiz o download do arquivo no meu Desktop e pedi para instalar. Ele efetuará um download e perguntará onde ele deve ser instalado (eu recomendo dentro do diretório Arquivos de Programas). A instalação não criou um link para o aplicativo. Você pode fazer isso. Para executá-lo, apelas dê um duplo click no executável.

O programa é gratuíto para fins não comerciais, no entanto não possui o código aberto.

Fitky - detecta picos e compensa linha base

Quem trabalha com separações, espectros e outros registros contendo picos sente falta de uma ferramenta que compense linha base, detecte picos, calcule suas áreas, determine seu centro, etc. São poucos os programas que fazem bem isso.

Essas tarefas não são fáceis de serem implementadas pelos engenheiros de software. Os registros podem apresentar picos assimétricos, linha base com deriva, ruído... Implementar isso dá trabalho e sai caro. No entanto, o Fityk faz somente isso e faz muito bem. Sua licença é livre (GPL) e roda em GNU/Linux, Windows, MacOSX e outras plataformas.

Ele é usado em cristalografia, cromatografia, eletroforese capilar, espectroscopia fotoelétrica, infra-vermelho, espectroscopia Raman e outros ainda não registrados. Na seção Docs do projeto há uma lista de publicações que mencionam o uso do Fityk.

Uma outra característica interessante é a possibilidade de criar scripts de comandos para processar grande quantidade de espectros em tarefas comuns.

Apesar de sua interface gráfica ser um pouco diferente, ele é atrativo por ser livre e ser especializado nessas tarefas. Desta forma vale a pena experimentar essa ferramenta. Ame-o ou deixe-o.

Links
http://en.wikipedia.org/wiki/Fityk
http://www.unipress.waw.pl/fityk/